第一，现行医院财务会计制度发挥的重要作用。一是财务管理得到加强。各地根据《》规定，先后制定了一系列财务管理制度，规范了医院的财务行为、加强了医院的财务管理。在当前财政投入不足的情况下，各医院努力挖掘自身潜力，在政策允许的范围内合理合法地组织收入，保证了业务经费的需要。同时，各医院严格内部管理，努力降低成本，在维持医院公益性质的同时促进了卫生事业的发展，实现了国有资产的保值增值。二是会计核算和会计信息披露日益规范。医院按照《》和会计工作规范的有关要求，建立健全了会计机构，配备了会计专业人员，并按照《》的规定开展会计核算和信息披露工作。在会计工作实践中，各地积极利用现代管理手段，大多数医院实现了会计电算化；大型医院实行了总会计师负责制，有力推进了会计工作的规范化、现代化。
第二，现行医院财务会计制度存在的问题及改革的必要性。一是存在的问题。现行两个制度只适用于公立医疗机构，在制度设计上将民办医院等非公立医疗机构排除在外。从实际情况看，现在非公立医疗机构占相当大的比重，非公立医院机构由于涉及税务事项，执行的是《企业会计制度》。两种制度在会计处理方式上存在的差异，必然导致两类医院披露的经营状况和财务成果等会计信息不可比。按现行两个制度的要求，医院应进行成本核算，并将成本分为医疗成本和药品成本。然而，现实情况却是医院存在着大量与主营业务联系不紧密、不能归集到医疗服务和药品销售成本中去的支出，如医院承担突发公共卫生事件、政府指令性任务、医疗救助等发生的费用，医疗费用的政策性减免、医疗纠纷赔偿等行业风险支出，与医疗保险机构等第三方搏弈造成的非控制性结算风险支出等。一般情况下，各医院都将这些支出作为成本予以反映，从而造成成本不实，结余失真，也不利于医院之间的对比分析。资产核算不实，虚增净资产。医院资产采用历史成本计价核算，不考虑减值、跌价。损失，对固定资产不计提折旧，因而不能反映医院资产的现实价值，也虚增了医院净资产，导致医院会计报表反映的财务状况不真实。二是改革的必要性。医药卫生体制改革的新要求。长期以来，“看病难、看病贵”问题突出，造成这一问题的原因除客观因素外，公立医院公益性质淡化、过分追求经济利益是重要原因。而公益性质淡化又与公立医院财务管理中过多注重对经济收入的考核有一定关系，这就要求审时度势，改革不适应当前形势的财务会计管理体制和管理方式。医院经济行为的新要求。医院收支规模不断扩大，投资主体多元化、经济行为的多样化，对财务会计工作提出了新的要求。一方面，医院的规模越来越大，如何加强对收入、支出的管理是财务会计工作面临的一个十分重要的课题。另一方面，外资和民营资本进入医疗服务领域越来越多，医院投资主体呈现多元化；同时，医院经济行为日益多样化，医院财务会计必须与之适应。会计改革的时代要求。我国会计技术规范与国际逐步趋同，对医院财务会计工作提出了新的挑战。医院如何紧跟会计改革的时代步伐，是一个十分现实而紧迫的任务。
第三，改革的原则及构想。改革的原则。当前，公立医院运行机制最大的弊端是鼓励医院创收，实行收入归己、自行分配，这种机制导致医院片面追求经济收入、公益性质淡化，必须改革。作为管理工具的医院财务会计制度，必须为医院总体改革服务，其改革必须与之相适应、相协调。医院财务会计制度改革必须符合法律并紧跟财政、会计改革步伐。一是必须符合国家法律、法规和规章的规定。《会计法》是会计工作的根本大法，医院财务会计制度修订要体现法律的基本要求，将法律的约束体现到制度中去。二是必须与事业单位财务规则、会计准则一致，符合国际会计惯例。医院会计作为事业单位会计的一个分支，修订财务会计制度时必须以事业单位财务规则、会计准则为依据，并注重借鉴企业会计改革的成功经验。三是必须与财政管理体制改革相适应。近年来，财政管理体制改革力度较大，如部门预算、国库集中收付、政府采购、政府收支分类改革、规范国有资产管理等，医院会计改革必须与这些改革要求相适应。四是必须满足社会各方对医院会计信息的需要。修订的医院财务会计制度必须满足财政、卫生、物价等政府主管部门管理的要求，满足医院内部管理的需要，满足投资人及银行等债权人的要求，满足社会公众对医院会计信息的要求。按照我国医院的分类方式，医院可分为营利性医院和非营利医院，非营利医院又可分为政府、国有企事业单位举办的公立非营利性医院和民办非营利医院，这些医院现在分属于不同的投资主体（或所有者）管理。按照我国医药卫生体制改革的总体思路，这些医院都将归属当地卫生行政部门统一管理。改革的构想。首先制定医院通用会计制度。建立适合各级各类医院的通用会计制度，满足卫生行政部门行业管理的需要。将“净资产”改为“所有者权益”，满足医院投资多元化对会计核算的要求；增加“结余”会计要素，适应不同类型医院在分配方式上的差异性；增设有关会计科目（如适合营利性医院纳税需要的“应交税金”等），以处理不同类型医院的会计业务。其次制定有差别的医院财务制度。在财务制度总体框架下，针对不同类型医院提出不同的管理要求。对公立医院，重点要求他们严格执行国家有关财经纪律和规章制度，切实加强收支管理，体现公益性质，实现资产保值增值；对其他非营利性医院和营利性医院，则重点要求其严格遵守国家法律法规，按规定披露会计信息，照章申报纳税（或税收减免）。在结余分配上，非营利性医院的结余主要用于事业发展，而营利性医院的结余在缴纳企业所得税后‘可对投资人进行分配。最后是改革总的指导思想：建立资本金制度，明晰产权关系，明确所有者、经营者各自的权利与责任，规范结余分配的项目和比例；科学界定成本项目和范围，正确划分收益性支出与资本性支出，增强成本核算和结余计算的真实性；改革会计要素的确认与计量方法，增强会计要素确认、计量的可靠性；建立行业风险准备金制度，改革坏账准备计提方法，增强医院抗风险能力；完善医院财务会计报告体系，增加会计报表附注及现金流量表，提高财务会计报告的真实性、完整性。
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