随着企业规模的扩大，企业所有者和经营者的分离，企业法人资产的控制权逐渐转移到经理人、会计人员等内部人员手里。企业内部控制制度的建设问题引起了社会各界的广泛关注。那么，在建立和完善企业内部控制制度过程中应注意那些问题呢?
内部与外部的关系问题
从实践上看，企业内部控制制度的作用主要表现为内外两个方面，对内有助于企业经营方针和目标的实现和资产的安全完整，有利于业务处理效率和企业内部管理水平提高；对外有助于国家政策、法律、法规的贯彻执行，有利于社会经济秩序的健康运行和整个国家管理水平的提高。因此，在制定企业内部控制制度时，首先应以保证国家政策、法律、法规有效贯彻执行为前提，如货币资金控制首先应符合国家有关现金管理制度、结算纪律和账户管理规定；其次再充分考虑企业内部管理中可能存在的薄弱环节和风险等情况。
规范性与实用性问题
企业内部控制制度按其工作范围大体可分为内部会计控制和内部管理控制两大方面，因此全面规范的企业内部控制制度应由国家有关权威机构(如财政部、国家经贸委等部门)联合组成专家组，在借鉴国外成功经验的基础上，结合我国国情统一制定出一套适合我国国情的相对全面和规范的企业内部控制制度体系，即总体框架，作为企业制定具体内部控制制度的依据，且在制定总体框架时应重点考虑企业内部控制制度体系是否全面和规范，不宜过多考虑具体企业情况如何。这样，既便于规范贯彻实施，又能克服过去政出多门，甚至相互矛盾的现象的情况。所谓实用性问题是指经过精心设计的具体企业内部控制制度应当能够满足具体企业需要的问题，对于这个问题，应由企业自己或委托有关有能力机构依据国家有关权威机构制定的企业内部控制制度体系(总体框架)，结合自身的特点加以取舍(不得随意取舍)和细化，制定出具体企业内部控制制度，以满足企业经营管理的需要。只有这样做，企业内部控制制度才能既相对统一规范，又能满足不同企业经营管理需求。
现实性与前瞻性问题
内部控制制度是企业内部管理的一项重要制度，也是促进企业提高管理水平的重要措施。因此，在制定企业内部控制制度时，首先要考虑企业管理中现存的薄弱环节和可能发生的风险的现实问题。如目前企业会计和企业管理中存在的会计信息质量不高、管理不善等现实问题应把它放在首位。其次，亦应考虑先进的管理思想和管理方法，对此应有超前意识，不能因为一时难以做到或别的企业没做就不予以考虑。只有这样，制定出来的制度才能既解决现实问题，又能引导企业向更好更高的管理方向努力和发展。
理论性与操作性问题
企业内部控制制度能否得到有效实施，很大程度上取决于其可操作程度。一般来讲，可操作程度越高，则控制效果就越好。因此，在制定企业内部控制制度时，应充分考虑其可操作性，在这个问题上，笔者以为应坚持内部控制制度与企业岗位分工和岗位责、权、利相结合及定量与定性相结合的原则，在制定具体控制程序和规则时，应尽量减少理论性的描述，能量化的要予以量化，做到条理分明、文字说明通俗易懂、定性恰当、定量合理。只有这样，才便于企业内部控制制度的贯彻落实。
有效性与固有局限问题
在对企业内部控制制度评价时，应充分考虑企业内部控制制度自身的固有局限性，因为没有一种制度是完美无缺的，即使是完美无缺的，也可能会因执行人员粗心大意、精力分散、判断失误或对指令误、滥用职权或屈从于外部压力而失效；因有关人员相互勾结、内外串通而失效；因经营环境、业务性质的变更而削弱或失效。因此，在对企业内部控制制度评价时，应充分考虑企业内部控制制度自身的固有局限性，不可因某一方面的失控，就不加分析地全盘否定。对于内部控制制度存在的固有局限应通过内部监督(如，会计监督、审计监督)加以解决。
内部控制制度实施问题
从以往的情况看，对内部控制制度的看法不尽相同。有的认为内部控制制度是保证实现经营活动的有效进行资产的安全和完整，防止、发现、纠正错误与舞弊，会计资料的真实、完整的一条有效措施，是提高企业经济效益的重要一环，对内部控制制度当作头等大事来抓，发挥了内部控制制度应有的作用。有的片面地理解为内部控制制度就是成本控制、会计控制或内部牵制制度等，未能全面理解企业内部控制制度的全面含义。更有甚者，认为内部控制制度，不就是让人放不开手脚的条条框框吗?只是碍于面子，无奈之中，为应付上级的需要或股东的要求而制定几条做做样子罢了，至于其是否得到实施，从不过问。这样不利于企业内部控制制度的有效实施，因此，在制定企业内部控制制度的同时，应结合岗位责任制定相应实施办法，以保证企业内部控制制度的有效实施，此外国家有关部门也应制定相应的实施办法，并将其纳入考核国有或国有控股企业经营者经济责任指标之一，作为选拔国有或国有控股企业经营者条件之一，以便企业内部控制制度的更有效地贯彻实施。其次，针对我国国有经济占较大比例的实际情况，就企业内部控制制度实施范围而言，应先在国有或国有控股企业中推行，而后再逐步推开。曹文火
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