（一）病种病例分型
病种医疗成本可按不分型的病种综合进行病种医疗成本核算。但是，这样核算的病种医疗成本是“病例组合”内涵很不完整的医疗成本。由于在同一种病种之中，因其病情轻重、合并症有无和多少，以及医疗技术手段等显著差异，其医疗消耗大不相同，其成本必然有很大差别。因此，最好是进行病种分型的病种医疗成本核算。就是对每个病种都按分型标准，各分为工a、b、c三种类型，分别进行医疗成本核算。
（二）病种医疗成本核算方法
病种医疗成本核算有两种方法：一是历史成本法。就是通过病种或病种病例分型的医疗成本的回顾调查，进行病种成本核算。二是标准成本法。就是对每个病种按病例分型制订规范化的诊疗技术方案；再根据诊疗方案所需医疗服务项目的标准成本核算病种医疗成本。
（三）历史成本法技术路线
病种医疗成本核算历史成本法，国内已有初步研究（详见《中华医院管理杂志》1993年第9期张鹭鹭等的《单病种成本核算》一文）。
历史成本法的主要特点，是必须进行较为大样本的病例回顾调查，以调查资料为依据，进行医疗技术项目归集，以计算出项目成本；同时将间接成本（即所谓非项目科室所发生的成本），按一定的分摊系数分配到病种医疗成本中，最后归集为病种医疗成本；并将回顾调查的实际费用与核算的病种医疗成本加以对比分析。
（四）标准成本法技术路线
标准成本法的主要特点是具有标准化要素，并与小样本病例回顾调查进行对比分析，可节省大样本病例回顾调查所需人力、物力。
标准成本法的优点是：既能使病种医疗成本计算科学合理；又具有保证医疗质量的意义。
首先强调病种的疾病诊断标准及病种病例分型标准化。
通过制定“病种（分型）的诊疗技术方案”，使医疗技术项目标准化。“病种诊疗技术方案”的具体内容即诊疗技术项目。每个诊疗技术项目均分为a、b、c三型填写具体剂量或使用次数和天数；手术治疗分a、b、c三型填写手术等级和麻醉方法；护理栏分a、b、c三型填写各级护理天数。在检诊技术项目中，包括x线检查、b超、ct、mri、心电图、心向量、超声心动、肺功能、心导管检查等，以及其他仪器检诊。在治疗技术项目中，包括中医中药治疗；治疗处置栏内包括吸氧、胸穿、腰穿、骨髓穿刺、换药和各种急救治疗等；仪器设备及其他治疗栏内包括放射治疗、理疗、高压氧舱、按摩、针灸以及碎石机治疗和心理治疗等。
制订标准住院天数。每个病种的平均住院天数分为a、b、c三型。对不易治愈的慢性病，病人住院天数不易制订标准，均按必要完成的检诊项目或完成若干疗程的平均住院天数测算。
最后，根据全国或者本地区医疗收费标准统一划价，测算出病种病例的医疗成本。
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